HEAL DSpace

Υπολογιστική ανάλυση βιολογικών δικτύων για επαναστόχευση φαρμάκων στη Μη-Αλκοολική Λιπώδη Νόσο του Ήπατος

Αποθετήριο DSpace/Manakin

Εμφάνιση απλής εγγραφής

dc.contributor.author Χαλά, Ναυσικά el
dc.contributor.author Chala, Nafsika en
dc.date.accessioned 2018-01-11T11:51:50Z
dc.date.available 2018-01-11T11:51:50Z
dc.date.issued 2018-01-11
dc.identifier.uri http://dspace.lib.ntua.gr/handle/123456789/46194
dc.rights Αναφορά Δημιουργού-Μη Εμπορική Χρήση-Όχι Παράγωγα Έργα 3.0 Ελλάδα *
dc.rights.uri http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/gr/ *
dc.subject βιολογικά δίκτυα el
dc.subject επαναστόχευση φαρμάκων el
dc.subject Μη-Αλκοολική Λιπώδης Νόσος του Ήπατος el
dc.subject R Bioconductor en
dc.subject pathway analysis en
dc.subject Connectivity Map en
dc.subject ανάλυση μονοπατιών el
dc.subject in vitro πειράματα el
dc.subject drug repositioning en
dc.subject Non-Alcoholic Fatty Liver Disease en
dc.title Υπολογιστική ανάλυση βιολογικών δικτύων για επαναστόχευση φαρμάκων στη Μη-Αλκοολική Λιπώδη Νόσο του Ήπατος el
dc.title Network based drug repositioning for Non-Alcoholic Fatty Liver Disease en
dc.contributor.department Τομέας Μηχανολογικών Κατασκευών και Αυτομάτου Ελέγχου - Εργαστήριο Εμβιομηχανικής και Συστημικής Βιολογίας el
heal.type bachelorThesis el
heal.classification ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ el
heal.classificationURI http://data.seab.gr/concepts/b50bf44af3b24e597323aa84bd26e06a0650789e
heal.language el el
heal.access free el
heal.recordProvider ntua el
heal.publicationDate 2017-10-24
heal.abstract Τα τελευταία χρόνια αναπτύσσονται υπολογιστικά μοντέλα τα οποία περιγράφουν διάφορες βιολογικές διεργασίες. Με αυτά τα μοντέλα ασχολείται ο κλάδος της συστημικής βιολογίας και δίνει νέες λύσεις στην διάγνωση, πρόγνωση και θεραπεία ασθενειών. Πεδίο εφαρμογής αποτελεί η μελέτη των μηχανισμών δράσης των φαρμάκων και ο πιθανός επαναπροσδιορισμός της χρήσης τους σε νέες ασθένειες (drug repositioning). Στην παρούσα εργασία γίνεται επαναστόχευση υπαρχόντων φαρμάκων για την αντιμετώπιση της μη αλκοολικής λιπώδης νόσου του ήπατος (Non-Alcoholic Fatty Liver Disease; NAFLD), η οποία είναι η πιο συχνή παθολογική κατάσταση του ήπατος, με συχνότητα εμφάνισης στο γενικό πληθυσμό έως 30% στις ανεπτυγμένες χώρες. Πολλές φαρμακολογικές ουσίες έχουν δοκιμαστεί για τη διαχείριση της νόσου, αλλά καμία θεραπεία δεν έχει εγκριθεί από τον US Food and Drug Administration (FDA) συγκεκριμένα για την αντιμετώπιση της νόσου. Στην εργασία αυτή αναπτύσσονται μοντέλα ανάλυσης των βιολογικών διεργασιών που σχετίζονται με τη νόσο NAFLD. Αρχικά προσδιορίστηκαν οι μηχανισμοί της νόσου μέσω ανάλυσης δικτύων από γονιδιακά δεδομένα δειγμάτων βιοψίας ασθενών με NAFLD. Έπειτα, με τη βοήθεια του βιοπληροφορικού εργαλείου Connectivity Map ελέγχονται οι εμπορικά διαθέσιμες βιοδραστικές ουσίες και επιλέγονται αυτές οι οποίες επηρεάζουν τα ίδια μονοπάτια με τη νόσο. Τέλος, η αποτελεσματικότητα ορισμένων ουσιών δοκιμάζεται σε πειραματικά μοντέλα της νόσου in vitro. el
heal.abstract There is an increased development of computational models over the last years in order to describe various biological processes. Systems biology uses these models as powerful tools in diagnosis, prognosis and treatment of diseases. These methods are also employed for the study of pharmacological agents mechanisms and drug repositioning. The aim of this project is to develop a new platform for drug repositioning in Non-Alcoholic Fatty Liver Disease (NAFLD), which is the most common liver disease with a prevalence of more than 30% in developed countries. Many pharmacological agents have been tested for the management of the disease, but none is approved from the USA Food and Drug Administration (FDA) so far. In this study, models for the analysis of biological networks related with NAFLD are developed. NAFLD mechanisms were identified through pathway analysis from gene expression data sets of biopsy proven patients. Next, the commercially available pharmacological compounds are screened through the bioinformatics tool Connectivity Map in order to choose those that affect the same pathways as the disease. Finally, the efficacy of these compounds is being tested on in vitro models of the disease. en
heal.advisorName Αλεξόπουλος, Λεωνίδας el
heal.advisorName Alexopoulos, Leonidas en
heal.committeeMemberName Σπιτάς, Βασίλειος el
heal.committeeMemberName Spitas, Vasilis en
heal.committeeMemberName Προβατίδης, Χριστόφορος el
heal.committeeMemberName Provatidis, Christophoros en
heal.academicPublisher Σχολή Μηχανολόγων Μηχανικών el
heal.academicPublisherID ntua el
heal.numberOfPages 111 el
heal.fullTextAvailability true


Αρχεία σε αυτό το τεκμήριο

Οι παρακάτω άδειες σχετίζονται με αυτό το τεκμήριο:

Αυτό το τεκμήριο εμφανίζεται στην ακόλουθη συλλογή(ές)

Εμφάνιση απλής εγγραφής

Αναφορά Δημιουργού-Μη Εμπορική Χρήση-Όχι Παράγωγα Έργα 3.0 Ελλάδα Εκτός από όπου ορίζεται κάτι διαφορετικό, αυτή η άδεια περιγράφετε ωςΑναφορά Δημιουργού-Μη Εμπορική Χρήση-Όχι Παράγωγα Έργα 3.0 Ελλάδα