Experimental Design of high-throughput Proteomic Experiments

Ζυμπελούδης, Ευάγγελος Δ.; Zympeloudis, Evangelos D.

dc.contributor.advisor	Αλεξόπουλος, Λεωνίδας	el
dc.contributor.author	Ζυμπελούδης, Ευάγγελος Δ.	el
dc.contributor.author	Zympeloudis, Evangelos D.	en
dc.date.accessioned	2014-02-24T10:08:57Z
dc.date.available	2014-02-24T10:08:57Z
dc.date.copyright	2013-07-24	-
dc.date.issued	2014-02-24
dc.date.submitted	2013-07-24	-
dc.identifier.uri	https://dspace.lib.ntua.gr/xmlui/handle/123456789/8811
dc.identifier.uri	http://dx.doi.org/10.26240/heal.ntua.11901
dc.description	109 σ.	el
dc.description.abstract	Η μελέτη δικτύων πρωτείνων και η εξακρίβωση των μονοπατιών μετάδοσης σήματος, αποτελεί τον ακρωγωνιαίο λίθο στην διαλεύκανση των κυτταρικών λειτουργιών και την κατανόηση της λειτουργείας των έμβιων οργανισμών. Την τελευταία πενταετία, κυτταρικά δίκτυα μετάδοσης σήματος, στα οποία οι αντιδράσεις μεταξύ των πρωτεινών προέρχονται από βιβλιογραφικά δεδομένα, έχουν βελτιστοποιηθεί με τη χρήση φωσφοπρωτεινικών δεδομένων, για την δημιουργία εξειδικευμέννων δικτύων για συγκεκριμμένους κυτταρικούς τύπους. Στόχος της παρούσας διπλωματικής εργασίας είναι η δημιουργία ενός αλγορίθμου που θα παράγει τη βέλτιστη δομή ενός φωσφοπρωτεινικού πειράματος, έτσι ώστε να βελτιώνει την ακρίβεια της μετέπειτα βελτιστοποίησης και ταυτόχρονα να κάνει χρήση όσο το δυνατόν λιγότερων δεδομένων. Προς το πάρον αλγόριθμος, που να εστιάζει στη δομή του πειράματος, δεν υπάρχει καταχωρημένος στη βιβλιογραφία.	el
dc.description.abstract	A new methodology using network flows theory is proposed, in order to design the optimal experimental setup for high-throughput proteomic experiments. An experimental setup consists of many experiments. An experiment is composed of stimuli, signals and inhibitors. The target of the the optimization is twofold: a) select data,which will facilitate and increase the accuracy of the post-experimental optimization, b) use the least amount of data possible	en
dc.description.statementofresponsibility	Ευάγγελος Δ. Ζυμπελούδης	el
dc.language.iso	en	en
dc.rights	ETDLocked-policy.xml	en
dc.subject	Πρωτεομικά πειράματα	el
dc.subject	Γραμμικός προγραμματισμός	el
dc.subject	Εμβιομηχανική	el
dc.subject	Συστημική Βιολογία	el
dc.subject	Σχεδιασμός Πειράματος	el
dc.subject	Σηματοδοτικά δίκτυα	el
dc.subject	Δίκτυα πρωτεινών	el
dc.subject	Κύτταρο	el
dc.subject	Ερεθίσματα	el
dc.subject	Αναστολείς	el
dc.subject	Proteomic experiments	en
dc.subject	Linear programming	en
dc.subject	Experimental design	en
dc.subject	Stimuli	en
dc.subject	Inhibitors	en
dc.subject	Signals	en
dc.subject	Systems biology	en
dc.subject	Cell	en
dc.subject	Protein interaction	en
dc.subject	Cellular networks	en
dc.title	Experimental Design of high-throughput Proteomic Experiments	en
dc.title.alternative	Βέλτιστος Σχεδιασμός Πρωτεομικών Πειραμάτων με τη χρήση Γραμμικού Προγραμματισμού	el
dc.type	bachelorThesis	el (en)
dc.date.accepted	2013-07-18	-
dc.date.modified	2013-07-24	-
dc.contributor.advisorcommitteemember	Προβατίδης, Χριστόφοος	el
dc.contributor.advisorcommitteemember	Τσαγγάρης, Σωκράτης	el
dc.contributor.committeemember	Αλεξόπουλος, Λεωνίδας	el
dc.contributor.committeemember	Προβατίδης, Χριστόφοος	el
dc.contributor.committeemember	Τσαγγάρης, Σωκράτης	el
dc.contributor.department	Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο. Σχολή Μηχανολόγων Μηχανικών. Τομέας Μηχανολογικών Κατασκευών & Αυτομάτου Ελέγχου	el
dc.date.recordmanipulation.recordcreated	2014-02-24	-
dc.date.recordmanipulation.recordmodified	2014-02-24	-