Μοντελοποίηση μονοπατιών μεταγωγής σήματος σε κύτταρα

Σταύρακας, Βασίλειος Α.; Stavrakas, Vassilis A.

dc.contributor.advisor	Αλεξόπουλος, Λεωνίδας	el
dc.contributor.author	Σταύρακας, Βασίλειος Α.	el
dc.contributor.author	Stavrakas, Vassilis A.	en
dc.date.accessioned	2014-05-06T10:54:45Z
dc.date.available	2014-05-06T10:54:45Z
dc.date.copyright	2014-01-14	-
dc.date.issued	2014-05-06
dc.date.submitted	2014-01-14	-
dc.identifier.uri	https://dspace.lib.ntua.gr/xmlui/handle/123456789/38433
dc.identifier.uri	http://dx.doi.org/10.26240/heal.ntua.7285
dc.description	188 σ.	el
dc.description.abstract	Η μοντελοποίηση των μονοπατιών μεταγωγής σημάτων μεταξύ των κυττάρων είναι υψίστης σημασίας για την κατανόηση της λειτουργίας τους. O όρος αυτός αναφέρεται στη διαδικασία αναγνώρισης των σχέσεων που διέπουν τη διάδοση των σημάτων από τη μία πρωτεΐνη στην άλλη, εξηγώντας τελικώς τρόπους με τους οποίους τα κύτταρα αντιδρούν και αποκρίνονται σε παράγοντες του βιοχημικού τους μικρό-περιβάλλοντος. Τα μονοπάτια σηματοδότησης αποτελούνται από ένα σύνολο πρωτεϊνικών αλληλεπιδράσεων, οι οποίες αναγνωρίζονται μέσω πρωτεϊνικών διαδικασιών υψηλής απόδοσης και διατίθενται μέσω διαδικτυακών βάσεων δεδομένων. Κατά τη διάρκεια των τελευταίων χρόνων έχουν αναπτυχθεί αρκετές μέθοδοι για τη μοντελοποίηση τέτοιων μονοπατιών αποσκοπώντας στην περιγραφή των λειτουργιών των κυττάρων και στην επεξήγηση της σχέσης αιτιότητας που διακρίνει τις ασθένειες και τα συμπτώματά τους. Κύριος στόχος των μεθόδων αυτών είναι η μοντελοποίηση των βιολογικών δικτύων σηματοδότησης ως λογικά μοντέλα και η χρήση συμβατικών μορφών βελτιστοποίησης (Ακέραιος Γραμμικός Προγραμματισμός – ILP και Μη – Γραμμικός Προγραμματισμός – NLP) συνδυάζοντάς τις με φωσφοπρωτεομικά δεδομένα υψηλής απόδοσης για τη δημιουργία μοντέλων ικανών να προβλέψουν τους μηχανισμούς σηματοδότησης του εξεταζόμενου κυτταρικού τύπου. Η παρούσα εργασία αποστασιοποιείται από τις προαναφερθείσες μεθόδους και τη λογική της δομημένης βελτιστοποίησης και στοχεύει στην ανάπτυξη ενός συνοπτικού κώδικα, ο οποίος θα μπορεί να δέχεται τα παραπάνω δεδομένα και να εξάγει την τελική τοπολογία (κατά βέλτιστο ανά περίσταση τρόπο), η οποία θα ανταποκρίνεται στα δεδομένα των μετρήσεων, λαμβάνοντας ταυτόχρονα υπ’ όψιν της τους υπάρχοντες περιορισμούς που υπαγορεύονται από τη θεωρία της βιολογίας, τη διεθνή βιβλιογραφία και τα υπάρχοντα δεδομένα στο διεθνές δίκτυο βάσεων δεδομένων.	el
dc.description.abstract	Modelling of Signal Transduction in Cells is highly significant for understanding of their function. It refers in the recognition process of the signal transduction between proteins, explaining the ways cells perceive their biochemical microenvironment.	en
dc.description.statementofresponsibility	Βασίλειος Α. Σταύρακας	el
dc.language.iso	el	en
dc.rights	ETDFree-policy.xml	en
dc.subject	Συστημική Βιολογία	el
dc.subject	Εμβιομηχανική	el
dc.subject	Μοντελοποίηση Μονοπατιών	el
dc.subject	Μεταγωγή Σήματος	el
dc.subject	Κύτταρα	el
dc.subject	Βελτιστοποίηση	el
dc.subject	Systems Biology	en
dc.subject	Bioengineering	en
dc.subject	Biomedical	en
dc.subject	Signal Transduction	en
dc.subject	Pathways Modelling	en
dc.subject	Cells	en
dc.subject	Biology	en
dc.subject	Proteins	en
dc.subject	Elisa	en
dc.subject	ILP	en
dc.title	Μοντελοποίηση μονοπατιών μεταγωγής σήματος σε κύτταρα	el
dc.title.alternative	Modelling of Signal Transduction Pathways in cells	en
dc.type	bachelorThesis	el (en)
dc.date.accepted	2014-01-09	-
dc.date.modified	2014-01-14	-
dc.contributor.advisorcommitteemember	Προβατίδης, Χριστόφορος	el
dc.contributor.advisorcommitteemember	Τσαγγάρης, Σωκράτης	el
dc.contributor.committeemember	Αλεξόπουλος, Λεωνίδας	el
dc.contributor.committeemember	Προβατίδης, Χριστόφορος	el
dc.contributor.committeemember	Τσαγγάρης, Σωκράτης	el
dc.contributor.department	Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο. Σχολή Μηχανολόγων Μηχανικών. Τομέας Μηχανολογικών Κατασκευών και Αυτομάτου Ελέγχου. Εργαστήριο Εμβιομηχανικής Τεχνολογίας και Συστημικής Βιολογίας	el
dc.date.recordmanipulation.recordcreated	2014-05-06	-
dc.date.recordmanipulation.recordmodified	2014-05-06	-