Μοριακή πρόσδεση ενώσεων με δράση στο ένζυμο της τυροσινάσης με χρήση in silico τεχνικών υπολογιστικής χημείας

Καλεμκερή, Όλγα; Kalemkeri, Olga

dc.contributor.author	Καλεμκερή, Όλγα	el
dc.contributor.author	Kalemkeri, Olga	en
dc.date.accessioned	2014-11-24T11:30:11Z
dc.date.available	2014-11-24T11:30:11Z
dc.date.issued	2014-11-24
dc.identifier.uri	https://dspace.lib.ntua.gr/xmlui/handle/123456789/39726
dc.identifier.uri	http://dx.doi.org/10.26240/heal.ntua.6603
dc.rights	Default License
dc.subject	Τυροσινάση	el
dc.subject	Μοριακή πρόσδεση	el
dc.subject	In silico μελέτες	el
dc.subject	Ενζυμική αμαύρωση	el
dc.subject	Aναστολείς	el
dc.subject	Tyrosinase	en
dc.subject	Molecular binding	en
dc.subject	In silico studies	en
dc.subject	Enzymatic browning	en
dc.subject	Inhibitors	en
dc.title	Μοριακή πρόσδεση ενώσεων με δράση στο ένζυμο της τυροσινάσης με χρήση in silico τεχνικών υπολογιστικής χημείας	el
heal.type	bachelorThesis
heal.classification	Χημεία	el
heal.classification	Φαρμακευτική Χημεία	el
heal.classification	Βιοχημεία	el
heal.language	el
heal.access	free
heal.recordProvider	ntua	el
heal.publicationDate	2014-10-08
heal.abstract	Η παρούσα διπλωματική εργασία αναφέρεται στο ένζυμο τυροσινάση, ένα ένζυμο που σχετίζεται με την αμαύρωση των τροφίμων αλλά και την εμφάνιση μελανών κηλίδων στο δέρμα και στοχεύει στην εύρεση πιθανών αναστολέων του. Στο πρώτο μέρος, η διπλωματική περιλαμβάνει μια ανασκόπηση της βιβλιογραφίας σε σχέση με τις λειτουργίες της τυροσινάσης. Συγκεκριμένα περιγράφονται οι ιδιαιτερότητες του ενζύμου, η αλληλομετατροπή μεταξύ των 4 οξειδωτικών καταστάσεων του, η χαρακτηριστική περίοδος υστέρησης, και η δυνατότητα αυτοενεργοποίησης του ενζύμου από κατεχόλες. Ακολουθεί βιβλιογραφική ανασκόπηση των οικογενειών γνωστών αναστολέων της τυροσινάσης, καθώς και περιγραφή της διαδικασίας προσομοίωσης μοριακής πρόσδεσης φαρμακευτικών μορίων. Στη συνέχεια, μελετώνται τα ιδιαίτερα χαρακτηριστικά καινούριων αναστολέων, που παρουσίασαν ενθαρρυντικά αποτελέσματα, και συγκρίνονται με αυτά γνωστών οικογενειών αναστολέων. Τα μόρια που εμφάνισαν ενδιαφέρουσα δράση ανασταλτική ή ενεργοποιητική είναι οι ρεσορκινόλες, οι κατεχόλες και τα καρβοξυλικά οξέα. Στόχος της διπλωματικής εργασίας, ήταν η εύρεση νέων αναστολέων του ενζύμου της τυροσινάσης μέσω μελετών εικονικής σάρωσης (virtual screening) με χρήση υπολογιστικών προγραμμάτων μοριακής πρόσδεσης (in silico docking) . Συγκεκριμένα, πραγματοποιήθηκε σάρωση της βιβλιοθήκης της Sigma Aldrich και επιλέχθηκαν ενώσεις (κατηγορία οξέων) που πληρούν τα κριτήρια για δυνητική αναστολή της λειτουργίας του ενζύμου της τυροσινάσης. Επιπρόσθετα, πραγματοποιήθηκαν δομικές τροποποιήσεις σε συγκεκριμένες ενώσεις με σκοπό την αύξηση της συγγένειας πρόσδεσης. Η διπλωματική εργασία πραγματοποιήθηκε κατά τη διάρκεια του ακαδημαϊκού έτους 2013-2014 στο Ινστιτούτο Βιολογίας, Φαρμακευτικής Χημείας και Βιοτεχνολογίας του Εθνικού Ιδρύματος Ερευνών.	el
heal.abstract	This diploma thesis examines the tyrosinase enzyme, responsible for the browning of food and the appearance of black spots, and discusses potential inhibitors. The thesis begins by citing past research related to the functions of tyrosinase. It explains the characteristics of the enzyme, the interconversion between the four oxidation states, the characteristic lag period, and the ability of the enzyme to be autoactivated by catechols. A review of the main families of known tyrosinase inhibitors follows, as well as a description of the virtual screening procedure. Subsequently, the characteristics and promising results of new inhibitors are studied and compared to the characteristics of known inhibitors families. Such molecules that demonstrate promising inhibitory or activating action are resorcinols, catechols and carboxylic acids. The goal of this thesis is to find new inhibitors of the enzyme tyrosinase through studies of virtual screening using molecular binding programs (in silico docking). Specifically, virtual screening of the Sigma Aldrich library was conducted and compounds (category of acids) meeting the criteria for potentially inhibiting the function of tyrosinase were selected. Additionally, structural changes were induced in specific compounds in order to increase their binding affinity. The diploma thesis was conducted during the academic year 2013-2014 at the Institute of Biology, Pharmaceutical Chemistry, and Biotechnology at the National Hellenic Research Foundation.	el
heal.advisorName	Δέτση, Αναστασία	el
heal.committeeMemberName	Βουγιούκα, Σταματίνα	el
heal.committeeMemberName	Παυλάτου, Ευαγγελία	el
heal.academicPublisher	Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο. Σχολή Χημικών Μηχανικών. Τομέας Χημικών Επιστημών	el
heal.academicPublisherID	ntua
heal.numberOfPages	107σ.
heal.fullTextAvailability	true