Επεξεργασία δεδομένων fMRI με χρήση FSL και SPM για τη μελέτη της εγκεφαλικής δραστηριότητας

Μηλούλης, Σταύρος-Θεοφάνης; Miloulis, Stavros-Theofanis

dc.contributor.author	Μηλούλης, Σταύρος-Θεοφάνης	el
dc.contributor.author	Miloulis, Stavros-Theofanis	en
dc.date.accessioned	2015-01-23T08:48:21Z
dc.date.available	2015-01-23T08:48:21Z
dc.date.issued	2015-01-23
dc.identifier.uri	https://dspace.lib.ntua.gr/xmlui/handle/123456789/40103
dc.identifier.uri	http://dx.doi.org/10.26240/heal.ntua.9242
dc.rights	Default License
dc.subject	Εγκέφαλος	el
dc.subject	Εγκεφαλική δραστηριότητα	el
dc.subject	Λειτουργική απεικόνιση μαγνητικού συντονισμού	el
dc.subject	Κατάσταση ηρεμίας	el
dc.subject	Επεξεργασία εικόνας	el
dc.subject	Brain activity	en
dc.subject	fMRI	en
dc.subject	DICOM	en
dc.subject	FMRIB Software library	en
dc.subject	Statistical parametric mapping	en
dc.title	Επεξεργασία δεδομένων fMRI με χρήση FSL και SPM για τη μελέτη της εγκεφαλικής δραστηριότητας	el
heal.type	bachelorThesis
heal.classification	Βιοϊατρική τεχνολογία και εμβιομηχανική	el
heal.classification	Ιατρική πληροφορική	el
heal.classificationURI	http://localhost:8080/healp/data/11/15/6
heal.classificationURI	http://localhost:8080/healp/data/11/15/8
heal.language	el
heal.access	free
heal.recordProvider	ntua	el
heal.publicationDate	2014-04-10
heal.abstract	Στην εργασία αυτή επιχειρείται μία παρουσίαση των τεχνικών επεξεργασίας δεδομένων λειτουργικής απεικόνισης μαγνητικού συντονισμού (fMRI), με στόχο την παρατήρηση της εγκεφαλικής δραστηριότητας μέσω επισήμανσης των ενεργοποιημένων περιοχών. Αρχικά δίνονται κάποια γενικά στοιχεία για τον εγκέφαλο και τους τρόπους χαρτογράφησής του και εν συνεχεία γίνεται αναφορά στις μεθόδους λήψης δεδομένων από τον εγκέφαλο με έμφαση στις τεχνικές MRI (απεικόνιση μαγνητικού συντονισμού) και fMRI. Όσον αφορά την τελευταία, παρουσιάζεται η χρήση της στη μελέτη της εγκεφαλικής δραστηριότητας τόσο όταν μελετάται η απόκριση σε κάποιο εξωτερικό ερέθισμα, όσο και όταν μελετάται η νευρική δραστηριότητα σε κατάσταση ηρεμίας (resting state). Στην πορεία παρουσιάζονται εκτενώς η μεθοδολογία επεξεργασίας των σχετικών εικόνων και η εφαρμογή της με χρήση των πακέτων λογισμικού FSL και SPM. Η μεθοδολογία αυτή εφαρμόζεται σε πραγματικά δεδομένα resting state fMRI και παρουσιάζονται τα αποτελέσματα, τα οποία προέκυψαν μέσω εφαρμογής ανάλυσης ανεξάρτητων συνιστωσών (ICA). Τέλος, αναφέρονται κάποιες χρήσιμες εφαρμογές των τεχνικών που αναλύονται στην κλινική πράξη. Η επισκόπηση των διαθέσιμων δεδομένων DICOM πραγματοποιήθηκε στο MATLAB με χρήση του πακέτου συναρτήσεων DICOMinfo_Toolbox, το οποίο σχεδιάστηκε ειδικά γι’ αυτό το σκοπό.	el
heal.abstract	This work comprises a presentation of the available techniques for processing functional magnetic resonance imaging (fMRI) data, in the pursuance of observing brain activity by indicating the activated areas. Initially, some general principles on brain and brain mapping methods are given, followed by a reference to the various ways of acquiring brain data, emphasising on magnetic resonance imaging (MRI) and fMRI. In regard to the latter, its use in studying brain activity both in the case of observing the response to some external stimuli and in the case of observing neural activity during resting state (rs-fMRI) is presented. Afterwards, the methodology of fMRI data processing and its application via FSL and SPM software packages is thoroughly presented. This methodology is implemented on actual rs-fMRI data and the corresponding results are demonstrated, which occurred via the use of independent component analysis (ICA). Finally, some useful applications in clinical practice of the methods analysed are referred to. The inspection of the available DICOM data was achieved using MATLAB and DICOMinfo_Toolbox, which is a set of functions designed specifically for this cause.	en
heal.advisorName	Ματσόπουλος, Γεώργιος	el
heal.committeeMemberName	Νικήτα, Κωνσταντίνα	el
heal.committeeMemberName	Ουζούνογλου, Νικόλαος	el
heal.academicPublisher	Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο. Σχολή Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών. Τομέας Συστημάτων Μετάδοσης Πληροφορίας και Τεχνολογίας Υλικών	el
heal.academicPublisherID	ntua
heal.numberOfPages	130 σ.
heal.fullTextAvailability	true