Mathematical Models of Double Strand Breaks Repair in DNA

Μπιλάλη, Βασιλική-Γεωργία; Bilali, Vasiliki-Georgia

dc.contributor.author	Μπιλάλη, Βασιλική-Γεωργία	el
dc.contributor.author	Bilali, Vasiliki-Georgia	en
dc.date.accessioned	2018-02-21T08:29:47Z
dc.date.available	2018-02-21T08:29:47Z
dc.date.issued	2018-02-21
dc.identifier.uri	https://dspace.lib.ntua.gr/xmlui/handle/123456789/46550
dc.identifier.uri	http://dx.doi.org/10.26240/heal.ntua.7533
dc.description	Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο--Μεταπτυχιακή Εργασία. Διεπιστημονικό-Διατμηματικό Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Δ.Π.Μ.Σ.) “ Μαθηματική Προτυποποίηση σε Σύγχρονες Τεχνολογίες και στα Χρηματοοικονομικά”	el
dc.rights	Default License
dc.subject	Μοντελοποίηση	el
dc.subject	Βιολογικά Συστήματα	el
dc.subject	Επιδιόρθωση Θραύσεων	el
dc.subject	Αριθμητική Ανάλυση	el
dc.subject	Μαθηματικοποίηση DNA	el
dc.subject	Biological Systems	en
dc.subject	Simulations	en
dc.subject	Numerical Analysis	en
dc.subject	DNA Repair	en
dc.subject	Modeling	en
dc.title	Mathematical Models of Double Strand Breaks Repair in DNA	en
dc.title	Μαθηματικά Μοντέλα Επιδιόρθωσης Διπλών Θραύσεων του DNA	el
heal.type	masterThesis
heal.classification	ΜΑΘΗΜΑΤΙΚΕΣ ΜΕΘΟΔΟΙ, ΜΟΝΤΕΛΑ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΙΣΜΟΥ, ΜΑΘΗΜΑΤΙΚΑ ΜΟΝΤΕΛΑ ΚΑΙ ΜΟΝΤΕΛΑ ΠΡΟΣΟΜΟΙΩΣΗΣ	el
heal.classificationURI	http://data.seab.gr/concepts/6ca5fa29c7950767cbdff3b3c2db129576fe533a
heal.language	en
heal.access	free
heal.recordProvider	ntua	el
heal.publicationDate	2017-10-01
heal.abstract	Το θέμα της διπλωματικής εργασίας είναι η αναπαραγωγή βιοχημικών κινητικών μοντέλων του Reza Taleei και Hooshang Nikjoo, που αναφαίρονται στην επιδιόρθωση βλαβών του DNA, οι οποίες προκαλούνται από ιονίζουσα ακτινοβολία. Η μελέτη της ιονίζουσας ακτινοβολίας υπάγεται στο πεδίο μελέτης της Ραδιοβιολογίας. Στο πρώτο κεφάλαιο θα περιγραφούν οι ορισμοί ραδιοβιολογίας, που μπορούν να θέσουν τις βάσεις για την κατανόηση και την περιγραφή του προβλήματός μας. Στο δεύτερο κεφάλαιο θα παραθέσουμε τις αρχές της μαθηματικής μοντελοποίησης, τις διαφορικές εξισώσεις, τις βιολογικές διαδικασίες και πως αυτές οι εξισώσεις επιλύονται από τον υπολογιστή. Η δημιουργία βλαβών είναι μια χημική διαδικασία. Οι χημικές αντιδράσεις μαζί με τα αντιδρώντα και τα προϊόντα εκφράζονται μέσα από τη κινητική μαζών(mass kinetics).Η χημική διεργασία του μαθηματικού μας μοντέλου στηρίζετα στο τρόπο που το ένζυμο προσδένεται στη θραύση. Το σύστημα των χημικών μας αντιδράσεων εκφράζεται από μη γραμμικές συνήθεις διαφορικές εξισώσεις, οι οποίες επιλύονται από τη γλώσσα προγραμματισμού C++ στο παραθυρικό περιβάλλον του Cygwin. Η επιδιόρθωση των θράυσεων θα μελετηθεί στο βιοχημικό μονοπάτι για τη μη ομόλογη ένωση άκρων, για τρεις περιπτώσεις απλές θραύσεις, σύνθετες και τις θραύσεις στην ετεροχρωματίνη. Στο τρίτο κεφάλαιο θα αναλύσουμε τα αποτελέσματα και τις γραφικές παραστάσεις των 3 διαφορετικών μοντέλων και θα δούμε ομοιότητες και διαφορές των αναμενόμενων αποτελεσμάτων. Επίσης θα παραθέσουμε στα ήδη υπάρχοντα μοντέλα δικές μας σταθερές και θα συζητήσουμε τα συμπεράσματα που λαμβάνουμε, με μια διάθεση αναζητήσεως προσδοκιών για το μέλλον και στόχους που θέλουμε να αντιμετωπίσουμε	el
heal.abstract	The theme of dissertation is the reproduction of Reza Tallei and Hooshang Nikjoo biochemical kinetic models for the repair damages of DNA induced by ionizing radiation. The study of ionizing radiation included in the branch of Radiobiology. In the first chapter we will describe the definitions of radiobiology, which could help us understand the base of our problem,as well as the biology description of our model. In the second chapter we will quote the principles of mathematical modelling, the differential equations, the biochemical processes and how these equations solved by the computer. The damages creation are a chemical process. Chemical reactions with reactants and products expressed by the mass kinetics. Also, chemical process which is defined in our mathematical model express the binding of enzyme in the site of damage. The above system described by non-linear differential equations and scalling methods, and the computational lanquage that we utilize for the solution of the mathematical system is C++ used in Cygwin platform. In the third chapter we will analyze the results and the graphs of models and how they differ from the expected results. In the last chapter we will say our results, and there will be a discussion about future plans and goals that we want to face.	en
heal.advisorName	Γεωργακίλας, Αλέξανδρος	el
heal.committeeMemberName	Γεωργακίλας, Αλέξανδρος	el
heal.committeeMemberName	Αναγνωστόπουλος, Κωνσταντίνος	el
heal.committeeMemberName	Καραφύλλης, Ιάσωνας	el
heal.academicPublisher	Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο. Σχολή Εφαρμοσμένων Μαθηματικών και Φυσικών Επιστημών	el
heal.academicPublisherID	ntua
heal.numberOfPages	79 σ.	el
heal.fullTextAvailability	true