Ανάπτυξη Τεχνικών Επεξεργασίας Δεδομένων στην Αντικαρκινική Θεραπεία και τη Μεταβολομική

Φιλντίση, Αριστέα-Ιωάννα; Filntisi, Aristea-Ioanna

dc.contributor.author	Φιλντίση, Αριστέα-Ιωάννα	el
dc.contributor.author	Filntisi, Aristea-Ioanna	en
dc.date.accessioned	2018-03-19T11:32:39Z
dc.date.available	2018-03-19T11:32:39Z
dc.date.issued	2018-03-19
dc.identifier.uri	https://dspace.lib.ntua.gr/xmlui/handle/123456789/46731
dc.identifier.uri	http://dx.doi.org/10.26240/heal.ntua.2848
dc.rights	Default License
dc.subject	Συμπλέγματα Αντισωμάτων-Φαρμάκων, Αντικαρκινική θεραπεία, Φαρμακευτικός σχεδιασμός, Πυρηνικός Μαγνητικός Συντονισμός, Ταυτοποίηση μεταβολιτών	el
dc.subject	Antibody-Drug Conjugates, Anticancer therapy, Drug design, Nuclear Magnetic Resonance, Metabolite identification	en
dc.title	Ανάπτυξη Τεχνικών Επεξεργασίας Δεδομένων στην Αντικαρκινική Θεραπεία και τη Μεταβολομική	el
dc.title	Development of Techniques for Processing Data in Anticancer Therapy and Metabolomics	en
dc.contributor.department	Τομέας Συστημάτων Μετάδοσης Πληροφορίας Και Τεχνολογίας Υλικών	el
heal.type	doctoralThesis
heal.classification	ΒΙΟΪΑΤΡΙΚΗ ΜΗΧΑΝΙΚΗ	el
heal.classification	ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ	el
heal.classificationURI	http://data.seab.gr/concepts/e21d30fc29c7c38310b1b9c23590a18fd030f6f2
heal.classificationURI	http://data.seab.gr/concepts/b50bf44af3b24e597323aa84bd26e06a0650789e
heal.language	el
heal.access	free
heal.recordProvider	ntua	el
heal.publicationDate	2018-03-02
heal.abstract	Το αντικείμενο της παρούσας διδακτορικής διατριβής είναι η διερεύνηση, η ανάπτυξη και η παρουσίαση τεχνικών επεξεργασίας αφ’ ενός βιολογικών δεδομένων, με επίκεντρο τη στοχευμένη αντικαρκινική θεραπεία, αφ’ ετέρου χημικών και φασματοσκοπικών δεδομένων, με επίκεντρο τη μεταβολομική. Αρχικά πραγματοποιείται μία εισαγωγή σε θέματα βιολογίας, ιατρικής και βιοπληροφορικής που αφορούν την αντικαρκινική θεραπεία. Στη συνέχεια παρουσιάζεται το πρώτο σκέλος της έρευνας, που επικεντρώθηκε στην ανάπτυξη μίας υπολογιστικής τεχνικής σχεδιασμού Συμπλεγμάτων Αντισωμάτων-Φαρμάκων, μίας κατηγορίας στοχευμένων αντικαρκινικών θεραπευτικών παραγόντων. Σκοπός της τεχνικής αυτής είναι η συμβολή στην αντιμετώπιση της δυσκολίας υπολογιστικού σχεδιασμού Συμπλεγμάτων Αντισωμάτων-Φαρμάκων με τις καθιερωμένες μεθόδους in silico φαρμακευτικού σχεδιασμού. Η τεχνική αξιοποιεί έναν αφινικό μετασχηματισμό, υλοποιήθηκε για δύο τρόπους σύζευξης του φαρμάκου στο αντίσωμα, και εφαρμόστηκε σε πραγματικά βιολογικά και φαρμακευτικά δεδομένα. Ακολούθως, επιχειρείται μία εισαγωγή σε θέματα μεταβολομικής με χρήση φασματοσκοπίας Πυρηνικού Μαγνητικού Συντονισμού και παρουσιάζεται το δεύτερο σκέλος της έρευνας, το οποίο επικεντρώθηκε στην ανάπτυξη ενός υπολογιστικού μεθοδολογικού σχήματος με αντικείμενο την αυτόματη ταυτοποίηση μεταβολιτών σε μονοδιάστατα φάσματα Πυρηνικού Μαγνητικού Συντονισμού πρωτονίου. Γίνεται αναφορά των μεθόδων προεπεξεργασίας και μείωσης δεδομένων που εφαρμόστηκαν και αναλύονται τα συστατικά τμήματα της μεθοδολογίας αναγνώρισης μεταβολιτών που αναπτύχθηκε. Παρουσιάζεται η διεργασία της αναζήτησης μεταβολιτών και παρατίθενται οι συναρτήσεις βαθμολόγησης των υποψήφιων συνόλων φασματικών κορυφών για τις διαφορετικές κατηγορίες κορυφών μεταβολιτών. Αναλύεται η στρατηγική επιλογής του καλύτερου συνδυασμού φασματικών κορυφών για κάθε μεταβολίτη και γίνεται αναφορά στην προτεραιοποίηση των υποψήφιων μεταβολιτών που υιοθετήθηκε στη μεθοδολογία. Η μεθοδολογία εφαρμόστηκε σε τεχνητά και πραγματικά φάσματα από διάφορες μελέτες, και συγκρίθηκε ως προς τα αποτελέσματά της με άλλες αυτόματες υπολογιστικές τεχνικές αναγνώρισης μεταβολιτών.	el
heal.sponsor	Ίδρυμα Κρατικών Υποτροφιών	el
heal.advisorName	Ματσόπουλος, Γιώργος	el
heal.committeeMemberName	Ουζούνογλου, Νικόλαος	el
heal.committeeMemberName	Κουτσούρης, Δημήτριος-Διονύσιος	el
heal.committeeMemberName	Πολιτόπουλος, Κώστας	el
heal.committeeMemberName	Κάβουρας, Διονύσης	el
heal.committeeMemberName	Ζουμπουλάκης, Παναγιώτης	el
heal.committeeMemberName	Βλαχάκης, Δημήτρης	el
heal.academicPublisher	Σχολή Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών	el
heal.academicPublisherID	ntua
heal.numberOfPages	148
heal.fullTextAvailability	true