Automatic Parameter Learning in BioImage Analysis Algorithms

Πήλιουρας, Σωτήριος; Piliouras, Sotirios

dc.contributor.author	Πήλιουρας, Σωτήριος	el
dc.contributor.author	Piliouras, Sotirios	en
dc.date.accessioned	2020-05-15T07:35:01Z
dc.date.available	2020-05-15T07:35:01Z
dc.identifier.uri	https://dspace.lib.ntua.gr/xmlui/handle/123456789/50586
dc.identifier.uri	http://dx.doi.org/10.26240/heal.ntua.18284
dc.rights	Αναφορά Δημιουργού-Μη Εμπορική Χρήση-Όχι Παράγωγα Έργα 3.0 Ελλάδα	*
dc.rights	Αναφορά Δημιουργού-Μη Εμπορική Χρήση-Όχι Παράγωγα Έργα 3.0 Ελλάδα	*
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/gr/	*
dc.subject	Μηχανική Μάθηση	el
dc.subject	Μικροσκοπία	el
dc.subject	Εκμάθηση Παραμέτρων	el
dc.subject	Machine Learning	en
dc.subject	Microscopy	en
dc.subject	Design Centering	en
dc.subject	Parameter Learning	en
dc.subject	Bioimage Analysis	en
dc.subject	Ανάλυση βιοεικόνας	el
dc.subject	Βιοιατρική	el
dc.title	Automatic Parameter Learning in BioImage Analysis Algorithms	en
heal.type	bachelorThesis
heal.classification	Computer Science	en
heal.language	el
heal.language	en
heal.access	campus
heal.recordProvider	ntua	el
heal.publicationDate	2019-11-12
heal.abstract	Το αντικείμενο της διπλωματικής αυτής εργασίας είναι ο αυτόματος υπολογισμός παραμέτρων σε αλγορίθμους ανάλυσης βιοεικόνας. Ο κλασικός τρόπος χειροκίνητης ρύθμισης των παραμέτρων παρουσιάζει ορισμένους περιορισμούς σε θέματα χρόνου, αποδοτικότητας, χρησιμοποιούμενης μνήμης και απαιτούμενης εμπειρίας του χρήστη. Την ίδια στιγμή η συνεχής αύξηση του όγκου των δεδομένων και των εικόνων στα βιολογικά πειράματα, απαιτεί εύρωστες και ευέλικτες λύσεις στα ζητήματα επεξεργασίας και ανάλυσης βιοεικόνας. Λαμβάνοντας υπόψιν τα παραπάνω προβλήματα, προτείνουμε ως λύση τη χρήση της design centering προσέγγισης. Έτσι λοιπόν, αναπτύξαμε μία εναλλακτική μέθοδο στη ρύθμιση παραμέτρων και την υλοποιήσαμε ως plugin για την πλατφόρμα ανάλυσης εικόνας Fiji. Στη συνέχεια, δοκιμάσαμε την επίδοση του προγράμματος μας για διαφορετικά δεδομένα εικόνων και πραγματοποιήσαμε μια αξιολόγηση ευχρηστίας (usability test). Η επιλογή του design centering για την επίλυση του συγκεκριμένου προβλήματος είχε ενθαρρυντικά αποτελέσματα ενώ η ανατροφοδότηση των συμμετεχόντων από την αξιολογιση ευχρηστιας ήταν αρκετά θετική. Τέλος, συμπεράναμε ότι ο χρόνος λειτουργίας μπορεί σε ορισμένες περιπτώσεις να είναι ένας περιορισμός, κάτι που προτείνεται να διερευνηθεί περαιτέρω για διαφορετικόυς αλγαρίθμους.	el
heal.advisorName	Στάμου, Γεώργιος	el
heal.committeeMemberName	Σταφυλοπάτης, Ανδρέας Γεώργιος	el
heal.committeeMemberName	Παπασπύρου, Νικόλαος	el
heal.academicPublisher	Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο. Σχολή Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών. Τομέας Τεχνολογίας Πληροφορικής και Υπολογιστών	el
heal.academicPublisherID	ntua
heal.fullTextAvailability	false