Μελέτη της απόκρισης ανθρώπινων κυττάρων στις σύνθετες βλάβες DNA με χρήση μεθόδων βιοπληροφορικής

Γιουκάκης, Ευάγγελος; Gioukakis, Efangelos

dc.contributor.author	Γιουκάκης, Ευάγγελος	el
dc.contributor.author	Gioukakis, Efangelos	en
dc.date.accessioned	2020-10-29T09:20:34Z
dc.date.available	2020-10-29T09:20:34Z
dc.identifier.uri	https://dspace.lib.ntua.gr/xmlui/handle/123456789/51663
dc.identifier.uri	http://dx.doi.org/10.26240/heal.ntua.19361
dc.rights	Default License
dc.subject	Σύνθετες βλάβες γενετικού υλικού βιοπληροφορική	el
dc.subject	Complex DNA damage bioinformatics	en
dc.title	Μελέτη της απόκρισης ανθρώπινων κυττάρων στις σύνθετες βλάβες DNA με χρήση μεθόδων βιοπληροφορικής	el
heal.type	bachelorThesis
heal.classification	Biophysics	en
heal.language	el
heal.access	free
heal.recordProvider	ntua	el
heal.publicationDate	2020-10-13
heal.abstract	Σκοπός της διπλωματικής εργασίας είναι η μελέτη της απόκρισης που παρουσιάζουν τα ανθρώπινα κύτταρα, όταν προκληθούν σύνθετες βλάβες στο γενετικό υλικό που βρίσκεται στο εσωτερικό τους. Οι σύνθετες ή ομαδοποιημένες βλάβες του γενετικού υλικού αποτελούν μεγάλο πρόβλημα για τα ανθρώπινα (και όχι μόνο) κύτταρα και συχνά οδηγούν σε μεταλλάξεις και κυτταρικό θάνατο. Η βιολογική τους σημασία έγκειται στην δυσκολία των κυττάρων να τις επιδιορθώσουν με επιτυχία σε αντίθεση με τις μεμονωμένες βλάβες που επιδιορθώνονται σχετικά εύκολα από τους επιδιορθωτικούς μηχανισμούς του DNA. Στο πλαίσιο της παρούσας διπλωματικής εργασίας χρησιμοποιήθηκαν μέθοδοι βιοπληροφορικής για τον εντοπισμό όλων των γονιδίων που συμμετέχουν στην αντίδραση των ανθρώπινων κυττάρων όταν στο γενετικό τους υλικό προκληθούν σύνθετες βλάβες. Στην συνέχεια έγινε φιλτράρισμα των αποτελεσμάτων ώστε να προκύψουν τα γονίδια εκείνα που έχουν την μεγαλύτερη πιθανότητα να συμμετέχουν όντως στην απόκριση των κυττάρων στις σύνθετες βλάβες DNA. Τα γονίδια που προέκυψαν μετά το φιλτράρισμα αναλύθηκαν περαιτέρω με την χρήση τεσσάρων διαφορετικών εργαλείων βιοπληροφορικής ανάλυσης για να επιβεβαιωθεί η ενεργοποίηση τους μετά την πρόκληση σύνθετων βλαβών στο DNA. Συγκεκριμένα ελέγχθηκαν οι βιολογικοί μηχανισμοί στους οποίους συμμετέχουν, η συσχέτιση τους με διάφορες ασθένειες, η επίδραση που έχουν στην επιβίωση των ασθενών σε διάφορους τύπους καρκίνου και η συσχέτιση τους με την κατάσταση της κυτταρικής γήρανσης. Από τους βιολογικούς μηχανισμούς που συμμετέχουν τα γονίδια που αναλύθηκαν, βρέθηκαν εννέα που υποδεικνύουν την ύπαρξη σύνθετων βλαβών DNA. Για τα περισσότερα γονίδια υπάρχει συσχέτιση τους με ασθένειες και τύπους καρκίνου ενώ επίσης για τα περισσότερα από αυτά υπάρχουν αναφορές για συσχέτιση με την κυτταρική γήρανση. Τέλος επισημάνθηκαν 15 γονίδια ως τα πλέον πιθανά να ενεργοποιούνται με την ύπαρξη σύνθετων βλαβών στο γενετικό υλικό των κυττάρων και τα οποία χρήζουν περαιτέρω έρευνας.	el
heal.advisorName	Γεωργακίλας, Αλέξανδρος	el
heal.committeeMemberName	Γεωργακίλας, Αλέξανδρος	el
heal.committeeMemberName	Αναγνωστόπουλος, Κωνσταντίνος	el
heal.committeeMemberName	Κυρίτσης, Απόστολος	el
heal.academicPublisher	Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο. Σχολή Εφαρμοσμένων Μαθηματικών και Φυσικών Επιστημών. Τομέας Φυσικής	el
heal.academicPublisherID	ntua
heal.numberOfPages	98 σ.	el
heal.fullTextAvailability	false