Πρωτεϊνικά chips, προβλήματα και ενίσχυση της αξιοπιστίας τους

Abstract

Οι πρωτεϊνικές μικροσυστοιχίες αποτελούν σήμερα τεχνολογία απαραίτητη για την κατανόηση του συνολικού ανθρώπινου πρωτεώματος. Μέσα από τη νέα αυτή τεχνολογία οι επιστήμονες θα είναι σε θέση να ανιχνεύσουν τροποποιήσεις των πρωτεϊνών κάτω από διάφορες συνθήκες, να διαπιστώσουν τις λειτουργίες και ιδιότητες όχι μόνο μη χαρακτηρισμένων αλλά και ήδη χαρακτηρισμένων πρωτεϊνών και να προχωρήσουν σε καλύτερη κατανόηση των ασθενειών και εύρεση στόχων φαρμάκων. Οι πρωτεϊνικές μικροσυστοιχίες όμως διαφέρουν σημαντικά από τις μικροσυστοιχίες DNA, καθώς οι πρωτεΐνες έχουν την τάση να αποδιατάσσονται. Αυτό έχει σαν αποτέλεσμα την μέχρι στιγμής έλλειψη μίας μοναδικής μεθόδου εργασίας, βέλτιστης για κάθε είδους πείραμα με τις πρωτεϊνικές μικροσυστοιχίες. Στην εργασία αυτή παρατίθενται όλα τα στάδια της απαραίτητης διαδικασίας για την διεξαγωγή πειραμάτων με πρωτεϊνικές μικροσυστοιχίες καθώς και οι πιθανοί κίνδυνοι και κάποιοι τρόποι αντιμετώπισής τους.

Protein microarrays (chips) constitute today a technology essential for the understanding of the whole human proteome. Through this technology scientists will be able to detect modifications of the proteins under various conditions, realize the functions and properties of not only not characterized but also already characterized proteins and move on to a better understanding of diseases and finding of drug targets. Protein microarrays differ though considerably from DNA microarrays, as proteins tend to denaturate. As a result of this, scientists have ot yet found a unique method of work, optimal for all kinds of experiments with protein microarrays. In this paper are mentioned all the steps of the needed procedure for the conduct of experiments with protein microarrays, as well as possible dangers and some ways of facing them.