Εφαρμογή μεθόδων αναγνώρισης προτύπων στην ταξινόμηση αλλοιώσεων του τραχήλου της μήτρας με αξιοποίηση πραγματικών δεδομένων με ελλειπή στοιχεία

Abstract

Σήμερα πολλές τεχνικές βασισμένες στην ανίχνευση και τυποποίηση του HPV DNA και στο mRNA είναι επικουρικές και ανταγωνιστικές της κυτταρολογικής εξέτασης, όμως δεν υπάρχει μία τέλεια τεχνική. Σε αυτή τη μελέτη στόχος είναι η αξιολόγηση των δέντρων ταξινόμησης (Classification and Regression Trees-CARTs) στην παραγωγή κανόνων ταξινόμησης των γυναικών και την εκτίμηση του κινδύνου για την ύπαρξη νεοπλασιών του τραχήλου της μήτρας. Σχεδιασμός: Η μελέτη βασίστηκε σε δεδομένα από 1625 περιπτώσεις. Σε αντίθεση με άλλες προσεγγίσεις χρησιμοποιήθηκαν ελλειπή δεδομένα προκειμένου να αξιοποιηθεί μεγαλύτερο τμήμα των διαθέσιμων δεδομένων, την εξαγωγή αποτελεσμάτων με μεγαλύτερη ακρίβεια και προκειμένου να προσεγγιστούν οι πραγματικές συνθήκες που παρατηρούνται στις γυναικολογικές κλινικές. Το δέντρο ταξινόμησης εφαρμόστηκε και αξιολογήθηκε στα επόμενα δεδομένα: κυτταρολογική εξέταση, τυποποίηση HPV DNA, ανίχνευση HPV mRNA με τεχνική NASBA και κυτταρομετρία ροής, ανοσοκυτταροχημική έκφραση της p16 και επιπλέον την ηλικία και το ιστορικό εγκυμοσύνης των γυναικών. Αποτελέσματα: Παρήχθησαν αλγόριθμοι για τη διαχείρηση των γυναικών, οι γυναικολόγοι μπορούν να χρησιμοποιούν αυτούς τους κανόνες σε συνδυασμό με τα διαθέσιμα αποτελέσματα των εξετάσεων προκειμένου να έχουν μία εκτίμηση του κινδύνου των γυναικών να έχουν υψηλόβαθμες αλλοιώσεις στον τράχηλο της μήτρας. Συμπεράσματα: Η πλέον σημαντική δοκιμασία είναι η κυτταρολογική εξέταση, όμως το δέντρο ταξινόμησης μπόρεσε να διαχειριστεί περιστατικά ακόμα και σε περιπτώσεις που η κυτταρολογική εξέταση δεν έδωσε αξιοποιήσιμη απάντηση. Η τεχνική έδωσε υψηλής ακρίβειας αποτελέσματα ακόμα και στις περιπτώσεις που δεν υπήρξαν αποτελέσματα από μερικές επικουρικές τεχνικές. Η επίδοση του δέντρου ταξινόμησης ήταν καλύτερη από κάθε μεμονωμένη τεχνική που εφαρμόστηκε σε αυτή τη μελέτη.

Nowadays numerous ascillary techniques detecting HPV DNA and mRNA compete cytology, however no perfect test exists. In this study we evaluated Classification and Regression Trees (CARTs) for the production of triage rules and we estimated the risk for Cervical Inaepithelial Cancer (CIN). Study Design: 1625 cases were used. In contrast to other approaches we used missing data to increase the data volume, obtain more accurate results and simulate real conditions in the everyday practice of the laboratories. The proposed CART was based on: the cytological results, HPV DNA typing, HPV mRNA detection based on NASBA and flow cytometry, p16 immunocytochemical expression and finally the age and parous status. Results: Algorithms useful for the triage of women were produced; gynecologists could apply these in conjuction with available examination results and conclude to an estimation of the risk of a woman harboring CIN , expressed as a propability. Conclusion: The most important test was the cytological examination. However the CART handled cases with inadequate cytological outcome and increased the diagnostic accuracy by exploiting the results of ancillary techniquesj even if there were inadequate missing data. The CART performance was better than any other single test involved in this study.