Μοντελοποίηση συμπεριφοράς κυττάρων με μεθόδους βελτιστοποίησης

Σακελλαρόπουλος, Θεόδωρος

dc.contributor.author	Σακελλαρόπουλος, Θεόδωρος	el
dc.date.accessioned	2018-07-10T09:51:38Z
dc.date.available	2018-07-10T09:51:38Z
dc.date.issued	2018-07-10
dc.identifier.uri	https://dspace.lib.ntua.gr/xmlui/handle/123456789/47246
dc.identifier.uri	http://dx.doi.org/10.26240/heal.ntua.2938
dc.rights	Αναφορά Δημιουργού - Παρόμοια Διανομή 3.0 Ελλάδα	*
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/gr/	*
dc.subject	Συστημική Βιολογία	el
dc.subject	Σηματοδοτικά δίκτυα κυττάρου	el
dc.subject	μικτός ακέραιος γραμμικός προγραμματισμός	el
dc.subject	Κυτταρική γήρανση	el
dc.subject	Φαρμακολογική στόχοι	el
dc.subject	Systems Biology	en
dc.subject	Cell signaling	en
dc.subject	mixed integer linear programming (MILP)	en
dc.subject	Drug repositioning	en
dc.subject	Cell aging	en
dc.title	Μοντελοποίηση συμπεριφοράς κυττάρων με μεθόδους βελτιστοποίησης	el
dc.title	Modeling cell behavior via optimization methods	en
heal.type	doctoralThesis
heal.classification	ΒΙΟΛΟΓΙΑ ΚΥΤΤΑΡΟΥ/ΚΥΤΤΑΡΙΚΗ ΒΙΟΛΟΓΙΑ	el
heal.classificationURI	http://data.seab.gr/concepts/2993934f31a10ddda5a7fb5e979600aa8bc7d69d
heal.language	el
heal.language	en
heal.access	free
heal.recordProvider	ntua	el
heal.publicationDate	2018-07-04
heal.abstract	Η εν λόγω διδακτορική διατριβή πραγματεύεται την μοντελοποίηση κυτταρικών σηματοδοτικών μονοπατιών με χρήση μεθόδων βελτιστοποίησης, με σκοπό την κατανόηση της διαφοροποίηση των κυττάρων μεταξύ φυσιολογικών και παθολογικών καταστάσεων και εφαρμογές στη συστημική φαρμακολογία. Ο υποψήφιος διδάκτωρ ανέπτυξε μεθόδους Ακέραιου Γραμμικού Προγραμματισμού (ΑΓΠ/ILP) για να εξερευνήσει συστηματικά την συνδεσμολογία των κόμβων που απαρτίζουν το δίκτυο μονοπατιών και να προτείνει μοντέλα που περιγράφουν συσχετίσεις που έχουν παρατηρηθεί πειραματικά. Οι αλγόριθμοι που αναπτύχθηκαν παρέκαμψαν μερικούς σημαντικούς περιορισμούς που είχαν παραδοσιακά οι σχετικοί αλγόριθμοι που έκαναν χρήση ILP τεχνικών όπως η αδυναμία μοντελοποίησης πειραμάτων με άγνωστη αρχική κατάσταση, η αδυναμία να εξερευνήσουν κυκλικά δίκτυα καθώς και η έμμεση μοντελοποίηση της παρουσίας ή μη σχετικών πρωτεϊνών. Κατά τη διάρκεια της διατριβής του ο υποψήφιος διδάκτωρ χρησιμοποίησε τους αλγόριθμους αυτούς για να μελετήσει ποικίλα βιολογικά φαινόμενα όπως η μεταφρασιμότητα των σηματοδοτικών δικτύων μεταξύ ποντικών και ανθρώπων, οι μηχανισμοί με τους οποίους διάφορα φάρμακα προκαλούν βλάβη στον πνεύμονα, κοινά μοτίβα τοξικότητας φαρμάκων σε διαφορετικά όργανα καθώς και η κυτταρική γήρανση.	el
heal.advisorName	Αλεξόπουλος, Λεωνίδας	el
heal.advisorName	Alexopoulos, Leonidas	en
heal.committeeMemberName	Αλεξόπουλος, Λεωνίδας	el
heal.committeeMemberName	Προβατίδης, Χριστόφορος	el
heal.committeeMemberName	Ματσόπουλος, Γεώργιος	el
heal.committeeMemberName	Κούρνια, Ζωή	el
heal.committeeMemberName	Χονδρογιάννη, Νίκη	el
heal.committeeMemberName	Χατζηιωάννου, Αριστοτέλης	el
heal.committeeMemberName	Τσιρίγος, Αριστοτέλης	el
heal.academicPublisher	Σχολή Μηχανολόγων Μηχανικών	el
heal.academicPublisherID	ntua
heal.fullTextAvailability	true