Δημιουργία βάσης δεδομένων με ειδική αναφορά στον καρκίνο του τραχήλου της μήτρας

Abstract

Ο καρκίνος του τραχήλου της μήτρας αποτελεί την πλέον θανατηφόρο μορφή καρκίνου στις γυναίκες. Βασική αιτία για την πρόκλησή του είναι η μόλυνση και η παραμονή στον οργανισμό του ιού Human papillomavirus (HPV), ενός σεξουαλικώς μεταδιδόμενου ιού που ανήκει στην οικογένεια Papillomaviridae. Οι μέχρι τώρα αναγνωρισμένοι τύποι του ιού ταξινομούνται σε γένη και στη συνέχεια σε είδη με βάση το ποσοστό ομοιότητας είτε του DNA είτε του δομικού γονιδίου L1 του ιού. Σε σχέση με την πρόκληση καρκίνου της μήτρας, οι τύποι χωρίζονται σε υψηλής και χαμηλής επικινδυνότητας, με τους HPV16 και HPV18 να ευθύνονται για το 70% των διαγνώσεων. Στη βάση δεδομένων που παρατίθεται, δίνονται οι «ταυτότητες» των μέχρι σήμερα αναγνωρισμένων τύπων του ιού και οι βασικότερες μεταλλάξεις τους, ενώ για τους τύπους HPV16 και HPV18 δίνονται όλες οι μεταλλάξεις που υπάρχουν καταχωρημένες στο διαδίκτυο είτε τμηματικά είτε ως πλήρες DNA.

Cancer of the cervix is the most lethal form of cancer in women. The basic cause is the infection and persistence in the body of the virus named Human papillomavirus (HPV), a sexually transmitted virus in the family of Papillomaviridae. The hitherto recognized types of the virus are classified into genera and then to species based on the percentage of similarity of either the whole genome or the structural L1 virus gene. In relation with the causation of cervical cancer, the virus types are divided into high risk and low risk categories, with HPV16 and HPV18 to account for 70% of diagnoses. The database given includes the "identity" of the hitherto recognized types of the virus and their basic strains. For the types HPV16 and HPV18, all mutations and strains that are listed on the web, either as whole or partial DNA registrations, are given.